Test du microbiote vaginal à domicile : analyse de la flore vaginale au niveau de l’espèce
Bien plus qu’un simple test vaginal. L’intégralité de votre flore vaginale décodée et analysée.
Avec Microbiome 360° Vaginal, Bactera propose l’une des analyses les plus avancées de la flore vaginale actuellement disponibles. Les tests classiques n’analysent que des gènes isolés. Nous décodons l’intégralité de l’ADN de votre écouvillon grâce au séquençage shotgun et identifions les lactobacilles, les anaérobies, les levures et les micro-organismes cliniquement pertinents jusqu’au niveau de l’espèce. En complément, nous recherchons sur votre écouvillon l’ADN de quatre agents pathogènes responsables d’infections sexuellement transmissibles. Toute détection d’IST doit être confirmée par un médecin.
Votre écouvillon est analysé en interne en Allemagne, à l’aide de méthodes bioinformatiques de pointe et selon les normes scientifiques les plus strictes. Vous obtenez ainsi une vue d’ensemble complète de votre microbiote vaginal : type de communauté bactérienne, lactobacilles protecteurs, potentiel fonctionnel et autres aspects essentiels de votre santé vaginale.
Un écouvillon. Une analyse à 360°. L’ADN complet. Des informations plus approfondies.
- Type de communauté bactérienne (CST) avec degré de correspondance
- Indice de protection vaginale (de 0 à 100)
- Dominance de Lactobacillus et part du D-lactate
- Diversité et dominance (indice de Shannon)
- Profil des Lactobacillus au niveau de l'espèce (6 espèces)
- Potentiel fonctionnel : acide lactique, D-lactate, fonction protectrice
- Gènes de la mucine et de la sialidase (8 gènes)
- Organismes associés à l'inflammation
- Profil de vaginose bactérienne (5 signaux)
- Levures et candidose (6 espèces de Candida)
- Organismes aérobies et opportunistes
- Profil de colonisation urogénitale
- Dépistage complémentaire des IST : chlamydia, gonorrhée, trichomonas, Mycoplasma genitalium
- Gènes de résistance aux antimicrobiens (8 familles de gènes)
- Profil complet des organismes (52) et données brutes à télécharger
- Mises à jour gratuites du rapport dès que de nouvelles analyses sont disponibles
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Produit : Microbiome 360° Vaginal
Microbiome 360° Vaginal est encore en développement
L’analyse et le rapport ne sont pas encore définitifs et peuvent évoluer d’ici leur publication. Les sections suivantes montrent à quoi le rapport pourrait ressembler et quelles analyses nous réalisons.
Ce qu’une analyse au niveau de l’espèce permet de mettre en évidence
La plupart des tests vaginaux utilisent des panels PCR portant sur une liste fixe d’organismes, ou le séquençage 16S, qui s’arrête généralement au niveau du genre. Nous lisons l’intégralité de l’ADN de votre écouvillon et identifions chaque espèce.
L. crispatus et L. iners diffèrent par leurs isomères d’acide lactique, leur stabilité et leur fonction protectrice. Nous présentons six espèces séparément.
Les levures sont détectées dans le même séquençage. Une détection de Candida apparaît donc dans le même rapport et dans le même contexte écologique que vos bactéries.
Les gènes de la sialidase et de la mucine, ainsi que les voies de production de l’acide D-lactique, sont lus directement dans l’ADN, en même temps que les organismes qui les portent.
Les fichiers FASTQ et les abondances brutes restent disponibles au téléchargement, et chaque fois qu’une nouvelle analyse devient disponible, vos données de séquençage existantes sont réanalysées et votre rapport mis à jour, gratuitement et sans nouvel écouvillon.
Ce que vous obtenez : un rapport qui explique votre flore vaginale au lieu de simplement la compter
Pour chaque valeur, vous trouverez le groupe de référence, ce qu’elle implique pour vous et les prochaines étapes à suivre. Utilisez le rapport de manière interactive dans le portail ou téléchargez-le.
- Interactif dans le portailSur ordinateur et mobile, disponible à tout moment sur my.bactera.de. Vous pouvez télécharger le rapport et le partager, par exemple avec votre médecin.
- Les normes scientifiques les plus strictesAnalyse très approfondie avec 25 millions de lectures appariées (paired-end) par échantillon. Sur demande, nous augmentons la profondeur de séquençage : contactez-nous avant de commander via notre page de contact ou à l’adresse info@bactera.de.
- Données brutes inclusesFichiers FASTQ et tableaux d'abondance à télécharger
Flore dominée par les Lactobacillus, principalement L. iners, avec environ 36 % de bactéries anaérobies associées à la vaginose bactérienne et une forte expansion de Gardnerella. Le rapport explique ce qui en découle.
Ce que couvre Microbiome 360° Vaginal
Dix domaines d’analyse à partir d’un seul écouvillon vaginal, le tout dans un seul rapport.
Type de communauté bactérienne (CST)
Attribue votre communauté bactérienne au profil écologique qui prédomine, y compris les états dominés par Lactobacillus et les états anaérobies diversifiés. Le type de communauté bactérienne fournit à votre rapport un cadre de référence établi : il indique lequel des 13 profils de référence votre communauté suit actuellement, le degré de correspondance et quel est le deuxième profil le plus proche.
Indice de protection vaginale
Un indice de 0 à 100 qui décrit à quel point votre communauté bactérienne se rapproche des compositions les plus régulièrement associées, dans les études publiées, à un environnement vaginal stable et bien protégé. Il prend en compte les lactobacilles protecteurs, les bactéries associées à une perturbation, la concentration de la communauté et la similitude avec une communauté optimale.
Comment lire votre score de 25 : une communauté peut obtenir un score entre 60 et 69 tout en étant dominée par L. iners seul. La vôtre obtient 25, car ce lactobacille partage l’espace avec une communauté anaérobie bien établie.
Diversité et dominance
La diversité décrit le nombre de bactéries différentes vivant dans votre échantillon et la manière dont elles sont réparties. Dans le vagin, une seule espèce de lactobacille assure généralement la majeure partie du travail, c’est pourquoi une diversité moindre est la norme saine ici. Le rapport compare votre indice de Shannon à celui des 1 850 femmes du groupe de référence et ajoute la dominance, le ratio et le nombre d’espèces.
Votre diversité (1,68) est supérieure à celle de 86 % du groupe de référence sain. Dans le vagin, une diversité moindre est la norme saine.
Profil des Lactobacillus au niveau de l’espèce
Six espèces assurent l’essentiel du travail de protection dans le vagin. Comme elles se comportent différemment les unes des autres, nous les présentons individuellement plutôt que sous la forme d’un chiffre unique pour l’ensemble des lactobacilles. Distinguer ces espèces nécessite un séquençage du génome complet.
En bref : votre communauté est dominée par les lactobacilles, mais sans lactobacille fortement protecteur. Seuls 0,56 % de votre communauté sont constitués d’espèces capables de produire de l’acide D-lactique.
Potentiel fonctionnel
Cinq panels estiment ce que votre communauté est génétiquement capable de faire : acide lactique et acidification, acide D-lactique, fonction protectrice des Lactobacillus, gènes de la mucine et de la sialidase, et organismes associés à l’inflammation. Chaque panel indique votre centile par rapport au groupe de référence et nomme les organismes qui déterminent le score.
Profils de santé vaginale
Quatre profils décrivent à quel point votre communauté bactérienne ressemble aux communautés décrites dans la littérature sur la vaginose bactérienne, les levures, la vaginite aérobie et la colonisation urogénitale, chacun avec les marqueurs et les organismes qui le sous-tendent.
Votre profil microbien : 52 micro-organismes
Le séquençage shotgun lit l’intégralité de l’ADN de votre communauté et identifie chaque espèce plutôt que de grands groupes. Le rapport présente les 52 micro-organismes pour lesquels les données en biologie vaginale sont les plus solides : la quantité de chacun que vous portez, la proportion de femmes du groupe de référence qui le portent et votre position par rapport aux femmes ayant le même type de communauté bactérienne.
Dépistage complémentaire des IST : infections sexuellement transmissibles
Votre écouvillon fait en outre l’objet d’une recherche de l’ADN de quatre agents pathogènes sexuellement transmissibles (IST) : Chlamydia trachomatis (chlamydia), Neisseria gonorrhoeae (gonorrhée), Trichomonas vaginalis (trichomonas) et Mycoplasma genitalium. Ainsi, une découverte fortuite importante ne passe pas inaperçue. En cas de détection, le rapport recommande de la confirmer par un test clinique chez votre médecin.
| Organisme | Qualité de détection | Résultat |
|---|---|---|
| Chlamydia trachomatis | Sensibilité faible | Non détecté |
| Neisseria gonorrhoeae | Sensibilité faible | Non détecté |
| Trichomonas vaginalis | Sensibilité modérée | Non détecté |
| Mycoplasma genitalium | Sensibilité faible | Non détecté |
Gènes de résistance aux antimicrobiens
Le séquençage nous permet de rechercher des gènes connus pour rendre les bactéries moins sensibles à certains antibiotiques. Le rapport examine huit familles de gènes et indique la classe de médicaments, le gène et le statut : des informations utiles pour votre médecin si vous deviez un jour être traitée pour une infection génitale.
| Classe de médicaments | Gène | Statut |
|---|---|---|
| Tétracyclines | tet(M) | Détecté |
| Macrolides et lincosamides | erm(B) | Détecté |
| Macrolides (efflux) | mef(A) | Non détecté |
| Lincosamides (nucléotidyl.) | lnu(A) | Non détecté |
| Nitroimidazoles | famille nim | Non détecté |
| Aminoglycosides | aph(3')-III | Non détecté |
| Glycopeptides | vanA / vanB | Non détecté |
| Bêta-lactamines (SARM) | mecA | Non détecté |
Tous deux figurent parmi les gènes de résistance les plus fréquents trouvés dans les prélèvements vaginaux. Le rapport explique la signification de chaque gène.
Liste complète de vos micro-organismes et mises à jour gratuites du rapport
Vous recevez le profil complet avec les 52 organismes identifiés dans votre échantillon, ainsi que les données brutes. Et votre rapport ne reste pas figé : nous ajoutons continuellement de nouvelles analyses, de nouveaux marqueurs et de nouvelles informations, et chaque fois qu’une nouvelle analyse devient disponible, vos données de séquençage existantes sont réanalysées et votre rapport est mis à jour, gratuitement et sans nouvel écouvillon. Avec un deuxième échantillon, votre rapport bénéficie en outre de la section « Évolution dans le temps » : si votre type de communauté bactérienne a changé, comment votre indice de protection a évolué, quelle proportion de votre communauté a été renouvelée et si votre lactobacille dominant est la même souche qu’auparavant.
Vaginose bactérienne, levures, organismes aérobies et colonisation urogénitale
Pour quatre thématiques, nous montrons à quel point votre communauté bactérienne se rapproche des profils décrits dans la littérature scientifique, et sur quels signaux repose le résultat.
Profil de vaginose bactérienne
5 signaux- Total des Lactobacillus
- Bactéries associées à une perturbation
- Rapport protecteurs : associés à une perturbation
- Diversité (Shannon)
- Nombre d'espèces de Gardnerella
Levures et candidose
6 espèces- Candida albicans
- Nakaseomyces glabratus
- Candida parapsilosis
- Candida tropicalis
- Pichia kudriavzevii
- Candida dubliniensis
Organismes aérobies et opportunistes
6 organismes- Escherichia coli
- Enterococcus faecalis
- Streptococcus agalactiae
- Staphylococcus aureus
- Klebsiella pneumoniae
- Groupe Streptococcus anginosus
Profil de colonisation urogénitale
6 organismes- E. coli
- Enterococcus faecalis
- Staph. saprophyticus
- Klebsiella pneumoniae
- Proteus mirabilis
- Strep. agalactiae (SGB)
Chaque profil présente son résultat avec les données qui le sous-tendent : votre valeur, la valeur de référence, les points et une interprétation en une phrase. Pour les levures et les organismes, le rapport indique également ceux qui ont été détectés et dans quelle proportion.
| Signal | Votre valeur | Référence | Points | Interprétation |
|---|---|---|---|---|
| Total des Lactobacillus | 58,96 % | ≥70 % typique des communautés stables | 1 / 2 | Plage de transition |
| Bactéries associées à une perturbation | 36,03 % | <5 % typique | 2 / 2 | Bien établies |
| Rapport protecteurs : perturbation | −1,81 | valeurs positives typiques | 2 / 2 | Fortement négatif |
| Diversité (Shannon) | 1,68 | médiane de 0,42 dans le groupe de référence | 1 / 2 | Élevée |
| Nombre d’espèces de Gardnerella | 3 espèces | en porter 3 ou plus est fortement associé à la vaginose bactérienne | 1 / 2 | Trois présentes |
Votre communauté ressemble beaucoup à celles décrites dans la vaginose bactérienne. Le rapport recommande d’en parler à un médecin, qui peut confirmer ce résultat en quelques minutes par une mesure du pH et un examen microscopique d’un frottis.
Ce que votre flore vaginale est génétiquement capable de faire : cinq panels avec centiles
Ici, la question n’est plus de savoir quels organismes sont présents, mais ce qu’ils sont réellement capables de faire. À partir des organismes et des gènes que nous détectons sur votre écouvillon, nous estimons ce que votre flore vaginale est génétiquement capable de faire. Chaque panel nomme les organismes qui le déterminent.
Potentiel d'acide D-lactique !
SoutienC’est, à lui seul, le chiffre le plus révélateur de votre rapport. L’acide lactique existe sous deux formes en miroir. L. crispatus, L. gasseri et L. jensenii produisent les deux ; L. iners ne produit que la forme L.
Seuls 0,56 % de votre communauté portent les gènes responsables de la production de D-lactate. Ce chiffre est inférieur à celui de 94 % du groupe de référence et constitue, à lui seul, l’explication la plus claire de votre indice de protection.
Ce qui détermine ce scoreL’acide lactique est la principale raison pour laquelle un vagin en bonne santé est acide. Ce panel estime la capacité globale de la communauté à le produire.
Votre capacité se situe près du milieu de la plage de référence, car L. iners produit bien de l'acide lactique, mais pas sous la forme D.
Ce qui détermine ce scoreUn résumé de la capacité de votre communauté à empêcher d’autres organismes de s’installer : par l’acidification, simplement en occupant l’espace, et en évinçant les bactéries associées à une perturbation.
Votre communauté obtient un résultat faible sur ces trois plans : l’indice de protection dit la même chose, sous un autre angle.
Ce qui détermine ce scoreLa muqueuse vaginale est recouverte d’une couche protectrice de mucus riche en sucres. Certaines bactéries produisent des enzymes appelées sialidases, qui éliminent les sucres situés à la surface de cette couche. Nous avons recherché dans votre échantillon les gènes codant ces enzymes.
Gènes détectés : 4 sur 8. Portés par Gardnerella, Prevotella timonensis et Prevotella bivia ; le rapport associe chaque gène à son porteur.
Ce qui détermine ce scoreCertaines bactéries vaginales sont régulièrement associées à des taux plus élevés de molécules de signalisation inflammatoire. Ce panel calcule quelle proportion de votre microbiote est composée de ces organismes.
Sept de ces organismes sont présents dans votre échantillon, en tête desquels Fannyhessea vaginae (6,20 %). Ensemble, leur part est supérieure à celle de 87 % du groupe de référence.
Ce qui détermine ce scoreSix espèces de Lactobacillus, présentées individuellement
Ce sont les bactéries qui assurent la protection proprement dite : elles transforment le sucre de la muqueuse vaginale en acide lactique et maintiennent l’acidité du milieu. Les espèces présentes comptent autant que leur quantité.
Illustration tirée d’un exemple de rapportDe plus, le groupe des Gardnerella (5 espèces), 13 anaérobies associés à la vaginose bactérienne, 10 autres anaérobies et mycoplasmes génitaux, 8 organismes aérobies et opportunistes et 6 levures : 52 organismes au total, chacun avec son abondance, sa prévalence et sa position par rapport aux femmes présentant votre type de communauté bactérienne.
Ce que nous recherchons en plus de votre flore vaginale
Nous recherchons également sur votre écouvillon six levures, l’ADN de quatre organismes sexuellement transmissibles et des gènes de résistance aux antibiotiques répartis en huit familles de gènes. Le tout à partir du même séquençage, sans frais supplémentaires.
Les levures font partie de la communauté vaginale et sont analysées à partir du même ADN que vos bactéries. Le rapport nomme chaque espèce individuellement, avec son statut de détection et son nombre de lectures.
Les quatre espèces de Candida les plus fréquemment décrites dans les échantillons vaginaux. C. albicans est la plus fréquente d’entre elles.
Ces deux espèces sont associées dans la littérature à des évolutions plus persistantes et sont donc présentées séparément.
Chaque espèce est indiquée comme détectée ou non détectée, avec son nombre de lectures et une interprétation dans le même contexte écologique que vos bactéries.
Outre votre flore vaginale, le rapport présente les organismes cliniquement pertinents issus du même séquençage : quatre organismes sexuellement transmissibles, six organismes aérobies et opportunistes ainsi que le profil de colonisation urogénitale.
Pour chaque organisme, le rapport indique la qualité de détection et le résultat. Un résultat positif pour une IST doit être confirmé par un médecin.
Ces organismes sont présentés avec leur abondance et analysés dans la section consacrée aux profils de santé vaginale.
Organismes que les études associent à la colonisation des voies urinaires, avec pour chacun le niveau de colonisation.
Certains micro-organismes vaginaux portent des gènes qui les protègent contre certains antibiotiques. Nous détectons huit familles de gènes dans votre échantillon et les associons aux classes de médicaments correspondantes.
Les antibiotiques cités sur les cartes sont des exemples de médicaments dont l’efficacité peut être affectée par chaque famille de gènes. Votre rapport indique lesquelles des huit familles de gènes ont été détectées dans votre échantillon et ce que cela signifie pour vous.
Gène tet(M). Les tétracyclines sont utilisées pour les infections génitales et l’acné, entre autres.
Gène erm(B). Pertinent pour la clindamycine, qui est prescrite pour la vaginose bactérienne.
Gène mef(A). Un mécanisme de pompe qui expulse les macrolides tels que l’azithromycine hors de la cellule.
Gène lnu(A). Une deuxième voie par laquelle les lincosamides peuvent perdre leur effet.
Famille nim. Pertinente pour le métronidazole, le traitement le plus courant de la vaginose bactérienne.
Gène aph(3')-III. Les aminoglycosides sont utilisés pour les infections plus graves.
Gènes vanA et vanB. Pertinents pour la vancomycine, un antibiotique de réserve contre les bactéries à Gram positif.
Gène mecA, le marqueur des staphylocoques résistants à la méthicilline.
- Lorsque les symptômes réapparaissent après plusieurs cures d'antibiotiques.
- En cas de symptômes vaginaux récurrents ou d'infections urinaires.
- Avant une intervention prévue.
- Après une hospitalisation.
Les gènes de résistance font partie de notre rapport standard. Celui-ci indique la classe de médicaments, le gène et le statut, afin que vous puissiez discuter du résultat avec votre médecin.
Tout ce dont vous avez besoin pour réaliser votre auto-prélèvement
Le kit est livré dans une boîte contenant tout le nécessaire pour réaliser votre auto-prélèvement à domicile. Ensuite, le tube est replacé dans la même boîte et vous l’envoyez au laboratoire à l’aide de l’étiquette de retour prépayée. Rien à acheter, rien à emballer et aucun rendez-vous à prendre.
Image de synthèse : boîte avec le contenu du kit-
1
Écouvillon avec tube de stabilisationPour l’auto-prélèvement vaginal. Maintient l’ADN de votre échantillon stable pendant l’envoi postal, sans réfrigération.
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2
Instructions illustrées étape par étapeVous guide pas à pas pour le prélèvement en quelques minutes, avec les consignes de préparation.
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3
Carte avec votre code d’enregistrement (Sample ID Card)Elle vous permet d’associer le kit en ligne à votre compte Bactera.
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4
Sachet hygiénique (film à bulles protecteur)Refermable et rembourré, pour transporter le tube en toute sécurité.
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5
Étiquette de retour prépayée sur la boîteLa même boîte est renvoyée au laboratoire. Fermez-la, apposez l’étiquette et déposez-la. Les frais de retour sont inclus dans le prix.
Pourquoi le shotgun révèle davantage qu’un test 16S
La plupart des tests de la flore vaginale analysent un seul gène marqueur ou ne cultivent que ce qui peut se développer en laboratoire. Nous analysons l’intégralité de l’ADN de votre écouvillon.
| Méthode de cultureCulture (autres prestataires) | Séquençage 16S16S (autres prestataires) | Métagénomique shotgunShotgun (Bactera) | |
|---|---|---|---|
| Ce qui est lu | Certaines bactéries et certains champignons | Un seul gène marqueur | L'intégralité de l'ADN de l'échantillon |
| Résolution | Quelques bactéries | Principalement au niveau du genre | Au niveau de l’espèce |
| Espèces de Lactobacillus distinguées | Non | Peu fiable | ✓Oui, six espèces individuellement |
| Espèces de Gardnerella distinguées | Non | Non | ✓Oui, quatre espèces |
| Levures | Partiellement | Non | ✓Oui, six espèces |
| Gènes fonctionnels | Non | Non | ✓Oui, D-lactate, sialidase et plus encore |
| Résistance aux antimicrobiens | Limité | Non | ✓Oui, huit familles de gènes |
La comparaison porte uniquement sur la profondeur de séquençage par échantillon, c’est-à-dire sur le nombre de lectures analysées. Elle se rapporte à la méthode d’analyse et non à des prestataires individuels. Une plus grande profondeur de séquençage signifie qu’une plus grande quantité d’ADN est analysée par échantillon.
Parmi les analyses de la flore vaginale de référence en Europe
La plupart des tests vaginaux sur le marché allemand sont des auto-tests de pH, des méthodes de culture ou des panels PCR ciblant quelques organismes. Nous séquençons l’intégralité de l’ADN de votre écouvillon, la méthode utilisée dans la recherche internationale sur le microbiote vaginal. Voici ce que cela signifie en chiffres.
Une profondeur de séquençage conforme aux standards de la recherche internationale sur le microbiote, plutôt que les quelque 10 000 lectures d’un test 16S classique. Si nécessaire, nous pouvons augmenter la profondeur de séquençage : contactez-nous avant de passer commande via notre page de contact ou à l’adresse info@bactera.de.
L. crispatus, L. iners, L. jensenii, L. gasseri, L. paragasseri et L. mulieris sont présentés séparément. C’est cette distinction qui compte en écologie vaginale.
Les gènes de résistance aux antibiotiques font partie de notre rapport standard et ne constituent pas un module complémentaire payant.
Un test 16S révèle la présence du genre Lactobacillus. Les espèces diffèrent considérablement par leur stabilité et leur métabolisme, et cette distinction est au cœur de l’analyse de la flore vaginale.
Nous rattachons votre communauté à l’un des 13 profils écologiques de référence publiés et indiquons le degré de correspondance.
La métagénomique shotgun au niveau de l’espèce est la norme de référence de la recherche internationale sur le microbiote. Dans le domaine des analyses grand public, elle compte parmi les rares méthodes utilisées à l’échelle mondiale.
Les levures sont analysées à partir du même ADN, de même que les gènes de résistance aux antibiotiques répartis en huit familles de gènes. Les deux font partie du rapport standard.
Les analyses bioinformatiques sont effectuées dans nos propres pipelines d’analyse à Cologne, au plus haut niveau scientifique. Nous n’achetons pas de rapports tout faits.
La liste complète des organismes, les fichiers FASTQ et les abondances brutes sont disponibles en téléchargement à tout moment, ainsi que la réanalyse gratuite de votre échantillon conservé.
Ce positionnement se réfère à la méthode d’analyse utilisée dans chaque cas et aux informations publiques des prestataires de tests vaginaux destinés aux consommateurs sur le marché germanophone, en 2026.
Quatre étapes pour obtenir votre rapport
Commandez et enregistrez votre kit
Chez vous sous 1 à 3 jours ouvrés. Enregistrez votre kit en ligne sur www.my.bactera.de avec le code figurant dans la boîte.
Réalisez votre auto-prélèvement à domicile
Auto-prélèvement selon les instructions illustrées, en quelques minutes et sans rendez-vous.
Renvoyez-le sans frais
La même boîte est renvoyée au laboratoire avec un affranchissement prépayé. L'analyse est réalisée par Bactera en Allemagne avec nos propres pipelines d'analyse bioinformatique selon les normes scientifiques les plus strictes.
Votre rapport sous 4 à 6 semaines
Dans votre compte Bactera sur www.my.bactera.de, avec des explications, une interprétation et des données brutes à télécharger.
Foire aux questions sur l'analyse vaginale
Qu’est-ce qu’un test du microbiote vaginal et que révèle-t-il ?
Un test du microbiote vaginal, également appelé test de la flore vaginale, examine les micro-organismes présents dans le vagin à partir d’un auto-prélèvement vaginal. Notre test utilise le séquençage shotgun de l’ADN pour analyser l’intégralité de l’ADN de l’échantillon et identifie les bactéries et les levures jusqu’au niveau de l’espèce. Le rapport présente votre type de communauté bactérienne, l’indice de protection vaginale, la diversité et la dominance, le profil des lactobacilles avec six espèces, cinq panels fonctionnels, quatre profils de santé vaginale, le profil microbien avec 52 organismes, un dépistage des organismes cliniquement pertinents et huit familles de gènes de résistance.
Qu’est-ce qu’un type de communauté bactérienne ?
Les communautés vaginales se répartissent en un petit nombre de profils récurrents appelés types de communauté bactérienne. Ils constituent le cadre autour duquel s’organise la littérature scientifique sur le microbiote vaginal. Votre échantillon est comparé à 13 profils de référence et associé au plus proche, avec le degré de correspondance, le deuxième profil le plus proche et une classification. Le rapport indique également la fréquence de chaque type dans le groupe de référence et les organismes qui définissent votre profil.
Pourquoi l’espèce de Lactobacillus est-elle importante ?
Parce que les espèces se comportent différemment les unes des autres. L. crispatus, L. gasseri et L. jensenii produisent à la fois de l’acide D- et L-lactique ; L. iners ne produit que la forme L. La forme D est celle qui est la plus étroitement associée à un environnement stable et bien protégé. C’est pourquoi nous présentons L. crispatus, L. iners, L. jensenii, L. gasseri, L. paragasseri et L. mulieris individuellement plutôt que sous la forme d’un seul chiffre global de Lactobacillus, chacun avec sa proportion, son centile et sa position par rapport aux femmes présentant le même type de communauté bactérienne que le vôtre.
Qu’est-ce que l’indice de protection vaginale ?
Un indice de 0 à 100 réparti en cinq plages, allant de « fortement protecteur » à « fortement perturbé ». Il indique dans quelle mesure votre communauté bactérienne se rapproche des compositions les plus régulièrement associées, dans les études publiées, à un environnement vaginal stable et bien protégé. Il repose sur quatre éléments : les lactobacilles protecteurs, les bactéries associées à une perturbation, la concentration de la communauté et sa similitude avec une communauté optimale. Le rapport indique vos points pour chaque élément et explique les principaux facteurs qui déterminent le score.
Que révèle le test concernant la vaginose bactérienne ou la candidose ?
Le rapport décrit à quel point votre communauté bactérienne ressemble aux communautés décrites dans la littérature sur la vaginose bactérienne : cinq signaux, chacun avec votre valeur, la valeur de référence, des points et une interprétation. Six espèces de levures, dont Candida albicans et Nakaseomyces glabratus, sont indiquées dans le même séquençage comme détectées ou non détectées. Chaque profil est expliqué dans le rapport afin que vous puissiez en parler directement lors de votre consultation.
Quelle est la différence entre le séquençage shotgun, le 16S et un panel PCR ?
Un panel PCR vérifie une liste fixe d’organismes sélectionnés à l’avance. Un test 16S lit un seul gène marqueur et s’arrête généralement au niveau du genre : il montre la présence de Lactobacillus, mais l’espèce reste inconnue. La métagénomique shotgun lit l’intégralité de l’ADN de l’écouvillon : six espèces de Lactobacillus et quatre espèces de Gardnerella individuellement, les levures dans le même séquençage, des gènes fonctionnels comme les gènes de la sialidase et les voies de production de l’acide D-lactique, ainsi que huit familles de gènes de résistance.
Comment dois-je prélever l’échantillon et à quel moment de mon cycle dois-je faire le test ?
À l’aide de l’écouvillon du kit de test, chez vous, en quelques minutes, en suivant les instructions illustrées. Effectuez le prélèvement en dehors de vos règles et évitez les médicaments vaginaux, les lubrifiants et les rapports sexuels pendant les 24 heures précédentes. Ne prenez pas de douche ni de bain juste avant le prélèvement. Après la prise d’antibiotiques ou d’antifongiques, attendez au moins deux semaines si vous souhaitez observer votre communauté dans son état habituel.
À quel groupe de référence mon échantillon est-il comparé ?
Avec 1 850 femmes en âge de procréer qui n’ont déclaré aucun symptôme vaginal au moment du prélèvement. Toutes les valeurs du rapport sont comparées à ce groupe, et beaucoup également à celles des femmes présentant le même type de communauté bactérienne que vous, car les organismes vaginaux sont généralement soit dominants, soit presque absents. Étant donné que les flores vaginales diffèrent considérablement selon les étapes de la vie, un groupe de référence comparable est utilisé pendant la grossesse ou après la ménopause.
Combien de temps prend l’analyse ?
Généralement 4 à 6 semaines après la réception de votre échantillon par le laboratoire. La raison réside dans la méthode : la métagénomique shotgun génère considérablement plus de données qu’un test 16S, lesquelles sont ensuite analysées dans nos propres pipelines. Vous recevrez un e-mail dès que votre rapport sera prêt.
Combien coûte le test et est-il remboursé par l’assurance maladie ?
Le test coûte 329 € en une seule fois, frais de port et retour prépayé en Allemagne inclus. Il s’agit d’une prestation à vos frais. En règle générale, les assurances maladie légales en Allemagne ne prennent pas en charge les frais d’analyse du microbiote. La prise en charge par une assurance privée ou un dispositif d’aide dépend de votre contrat.
L’analyse permet-elle également de dépister les infections sexuellement transmissibles (IST) ?
Oui, en complément. Votre écouvillon fait en outre l’objet d’une recherche de l’ADN de Chlamydia trachomatis (chlamydia), de Neisseria gonorrhoeae (gonorrhée), de Trichomonas vaginalis (trichomonas) et de Mycoplasma genitalium, afin qu’une découverte fortuite importante ne passe pas inaperçue. Pour situer les choses : ce dépistage repose sur le séquençage et il est moins sensible que les tests PCR utilisés par les médecins pour rechercher les infections sexuellement transmissibles. Toute détection doit donc être confirmée par votre médecin, et pour un dépistage régulier des IST, le test réalisé par votre médecin ou dans un centre de dépistage reste la bonne solution.
Que signifient les mises à jour gratuites du rapport et qu’advient-il de mes données ?
Votre échantillon est analysé en Allemagne et traité sous forme pseudonymisée. Les données génétiques constituent des catégories particulières de données à caractère personnel au sens de l’article 9 du RGPD. Vos données de séquençage sont conservées en toute sécurité : dès qu’une nouvelle analyse devient disponible, vos données de séquençage existantes sont réanalysées et votre rapport est mis à jour gratuitement, sans que vous ayez à envoyer un nouvel écouvillon. Avec un second échantillon, votre rapport intègre la section « Évolution dans le temps ». Vous pouvez télécharger à tout moment la liste complète des organismes identifiés, vos fichiers FASTQ et vos données brutes d’abondance. Vos données ne sont jamais vendues et vous pouvez vous opposer à leur conservation à tout moment.