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Le sommeil peut-il influencer le microbiote intestinal ?

Des recherches récentes suggèrent que le sommeil, les rythmes circadiens et le microbiote intestinal sont étroitement liés. Découvrez comment le sommeil pourrait influencer votre écosystème microbien et votre santé intestinale globale.

  • 6 min de lecture
Can Sleep Influence the Gut Microbiome?

Le sommeil et la santé intestinale sont rarement abordés ensemble.

La plupart des gens associent le microbiote à l’alimentation, à la digestion, aux antibiotiques ou aux probiotiques, mais pas au sommeil. Pourtant, ces dernières années, les scientifiques s’intéressent de plus en plus à une question fascinante :

Le sommeil peut-il influencer le microbiote intestinal ?

La réponse courte est :
probablement oui.

Et cette relation pourrait fonctionner dans les deux sens.

La recherche moderne suggère que le sommeil, les rythmes circadiens, les hormones du stress, le métabolisme, la signalisation immunitaire et le microbiote intestinal sont profondément interconnectés¹.

Le microbiote intestinal suit un rythme quotidien

L’une des découvertes les plus intéressantes dans le domaine du microbiote est qu’il n’est pas statique.

Les populations microbiennes et l’activité métabolique semblent fluctuer au cours de la journée en fonction de :

  • des cycles veille-sommeil
  • des horaires des repas
  • des taux d’hormones
  • des rythmes circadiens
  • de l’exposition à la lumière²

Dans des études menées sur des animaux et des humains, les chercheurs ont observé des variations rythmiques de la composition microbienne et de l’activité des gènes microbiens sur des cycles de 24 heures.

Cela suggère que le microbiote se comporte moins comme une population bactérienne fixe que comme un écosystème dynamique synchronisé avec l’horloge biologique de l’organisme.

Que se passe-t-il en cas de perturbation du sommeil ?

Les scientifiques étudient activement comment un sommeil insuffisant ou une perturbation des rythmes circadiens peut influencer le microbiote.

La recherche a établi un lien entre le manque de sommeil et les rythmes circadiens irréguliers et :

  • une diversité microbienne réduite
  • une altération de la composition microbienne
  • des perturbations métaboliques
  • une augmentation de la signalisation inflammatoire
  • des modifications de la régulation de la barrière intestinale³

Par exemple, les travailleurs postés, qui souffrent souvent de perturbations chroniques des rythmes circadiens, présentent fréquemment des différences métaboliques et inflammatoires par rapport aux personnes ayant des cycles de sommeil plus stables⁴.

Les chercheurs étudient désormais si le microbiote pourrait jouer un rôle dans certains de ces effets.

Il est important de noter que ce domaine est encore en développement. Les scientifiques ne savent pas encore avec certitude si les modifications du microbiote en sont la cause, la conséquence ou font partie d’un réseau physiologique plus vaste impliquant le sommeil et le métabolisme.

L’axe intestin-cerveau pourrait relier le sommeil au microbiote

L’une des raisons pour lesquelles ce sujet suscite tant d’intérêt est l’axe intestin-cerveau.

L’intestin et le cerveau communiquent constamment par l’intermédiaire de :

  • du système nerveux
  • des hormones
  • de la signalisation immunitaire
  • des métabolites microbiens
  • des voies de réponse au stress

Certains métabolites microbiens produits dans l’intestin peuvent influencer la signalisation des neurotransmetteurs, la biologie circadienne et la régulation immunitaire⁵.

Parallèlement, un mauvais sommeil peut augmenter les hormones du stress telles que le cortisol, altérer les habitudes alimentaires et influencer les voies inflammatoires, autant de facteurs susceptibles d’affecter indirectement l’écosystème intestinal.

Les scientifiques considèrent de plus en plus le sommeil, le stress, le métabolisme et le microbiote comme faisant partie d’un réseau biologique interconnecté plutôt que comme des systèmes isolés.

Les rythmes circadiens comptent plus qu’on ne le pense

Les modes de vie modernes perturbent souvent les rythmes circadiens naturels.

L’exposition à la lumière artificielle, les horaires de repas irréguliers, l’utilisation tardive d’écrans, le travail de nuit, le stress et la restriction chronique du sommeil peuvent tous influencer les systèmes de régulation du rythme biologique.

Les chercheurs pensent désormais que ces perturbations peuvent non seulement affecter le sommeil lui-même, mais aussi :

  • la composition microbienne
  • la régulation métabolique
  • la fonction immunitaire
  • l’intégrité de la barrière intestinale⁶

Certaines études suggèrent même que le moment des repas peut influencer le rythme microbien indépendamment de l’apport calorique.

C’est l’une des raisons pour lesquelles la science du microbiote se recoupe de plus en plus avec la chronobiologie, l’étude des systèmes de régulation du rythme biologique.

Le sommeil, l’alimentation et le microbiote sont étroitement liés

Le sommeil influe également sur le comportement.

Les personnes qui dorment mal sont plus susceptibles de :

  • consommer des aliments ultra-transformés
  • manger de manière irrégulière
  • avoir envie d’aliments très sucrés
  • moins faire d’exercice
  • être plus stressées

Tous ces facteurs peuvent indirectement façonner le microbiote intestinal.

Il est donc difficile pour les scientifiques de distinguer les effets directs du microbiote des influences plus larges du mode de vie. Mais une chose devient de plus en plus claire :

Le microbiote ne réagit pas à un seul facteur isolé.

Il réagit à l’ensemble des habitudes de vie.

La recherche moderne sur le microbiote adopte une approche plus systémique

Les anciennes études sur le microbiote se concentraient souvent sur l’identification de groupes bactériens uniques associés à des affections spécifiques.

La recherche moderne s’oriente vers une approche bien plus large : comprendre le microbiote comme faisant partie d’un écosystème biologique plus vaste impliquant le métabolisme, l’immunité, la biologie circadienne et les facteurs environnementaux⁷.

Cette perspective systémique est l’une des raisons pour lesquelles les technologies à haute résolution, telles que le séquençage métagénomique shotgun, deviennent de plus en plus importantes.

Les chercheurs ne se demandent plus uniquement :
« Quelles bactéries sont présentes ? »

Ils se demandent de plus en plus :

  • Quelles fonctions ces microbes assurent-ils ?
  • Quelle est la stabilité de l’écosystème ?
  • Comment le microbiote réagit-il aux facteurs liés au mode de vie ?
  • Comment les réseaux microbiens interagissent-ils avec l’hôte ?

Le sommeil fait désormais partie de cette réflexion.

Vous souhaitez savoir comment votre microbiote peut être lié à votre sommeil ?

Notre analyse Microbiome 360° comprend un panel fonctionnel Sommeil et rythme circadien, conçu pour fournir des informations sur les voies microbiennes associées à la régulation du sommeil et à la biologie circadienne. Bien qu’il ne soit pas destiné à diagnostiquer les troubles du sommeil, il peut vous aider à mieux comprendre l’un des aspects de la relation complexe entre votre microbiote intestinal et votre sommeil.

Références scientifiques

  1. Voigt RM et al. Circadian disorganization alters intestinal microbiota. PLoS ONE. 2014.
  2. Thaiss CA et al. Transkingdom control of microbiota diurnal oscillations promotes metabolic homeostasis. Cell. 2014.
  3. Benedict C et al. Acute sleep deprivation alters the gut microbiome in humans. Molecular Metabolism. 2016.
  4. Reynolds AC et al. The impact of shift work on the human microbiome. Chronobiology International. 2017.
  5. Cryan JF et al. The microbiota-gut-brain axis. Physiological Reviews. 2019.
  6. Zarrinpar A et al. Diet and feeding pattern affect the diurnal dynamics of the gut microbiome. Cell Metabolism. 2014.
  7. Knight R et al. The microbiome and human biology. Annual Review of Genomics and Human Genetics. 2017.
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