Candida y el microbioma intestinal

El microbioma intestinal humano consta de miles de millones de microorganismos que, en conjunto, forman un ecosistema microbiano sumamente complejo. Además de bacterias, este ecosistema también incluye hongos, virus y muchos otros microorganismos. Una de las levaduras que se menciona con especial frecuencia es Candida¹.

Muchas personas asocian principalmente Candida con términos como «sobrecrecimiento de Candida» o con el uso de antibióticos. Sin embargo, la realidad científica es mucho más compleja de lo que suele presentarse.

Ciertas especies de Candida pueden formar parte de forma natural del microbioma intestinal incluso en personas sanas². Por lo tanto, el factor clave no es simplemente la presencia de Candida, sino el equilibrio de todo el ecosistema microbiano intestinal.

La investigación actual sobre el microbioma estudia intensamente cómo interactúan los hongos con las bacterias, la dieta, los antibióticos y la barrera intestinal.

¿Qué es Candida?

Candida se refiere a un grupo de hongos levaduriformes que pueden encontrarse de forma natural en la piel, las superficies mucosas y el intestino³.

La especie más conocida es:

• Candida albicans

Esta especie fúngica se encuentra entre las levaduras más estudiadas del cuerpo humano.

Es importante destacar que:

La detección de Candida no indica automáticamente una enfermedad. Muchos microorganismos, incluidas las levaduras, pueden formar parte de un ecosistema microbiano normal⁴.

Lo más importante es el equilibrio entre los distintos grupos microbianos.

El microbioma intestinal consta de mucho más que bacterias

Muchas de las conversaciones sobre la salud intestinal se centran casi exclusivamente en las bacterias. Sin embargo, en realidad, el microbioma intestinal es mucho más complejo.

También incluye:

• Bacterias

• Hongos

• Virus

• Bacteriófagos

• Arqueas

El conjunto de hongos del microbioma se denomina micobioma⁵.

Aunque los hongos están presentes en cantidades mucho menores que las bacterias, también pueden desempeñar funciones importantes en el ecosistema intestinal.

Resulta especialmente fascinante que:

Los hongos y las bacterias interactúan constantemente en el intestino. Algunos microorganismos compiten entre sí, mientras que otros se ayudan mutuamente o influyen conjuntamente en los procesos metabólicos⁶.

¿Qué papel desempeñan los antibióticos?

Los antibióticos se encuentran entre los factores más importantes que influyen en el equilibrio bacteriano del intestino⁷.

Como los antibióticos actúan sobre las bacterias y no sobre los hongos, los tratamientos con antibióticos pueden alterar el equilibrio entre los microorganismos bacterianos y los fúngicos.

Los estudios demuestran que ciertas especies de Candida pueden detectarse con mayor frecuencia tras la exposición a antibióticos⁸.

Sin embargo, esto tampoco indica automáticamente una enfermedad. Más bien pone de relieve la sensibilidad del ecosistema microbiano intestinal a las influencias externas.

Entre los factores especialmente relevantes se incluyen:

• Tratamientos repetidos con antibióticos

• Uso prolongado de antibióticos

• Reducción de la diversidad bacteriana

• Alteración de la resiliencia microbiana

Candida y diversidad bacteriana

La investigación actual sobre el microbioma estudia intensamente la relación entre la diversidad bacteriana y la estabilidad microbiana⁹.

A menudo se considera que un microbioma diverso es más resistente a los factores de estrés externos.

Cuando la diversidad bacteriana disminuye, por ejemplo tras tomar antibióticos o debido a una alimentación muy desequilibrada, el equilibrio microbiano puede alterarse¹⁰.

Resulta especialmente interesante que:

Algunos estudios sugieren vínculos entre la reducción de la diversidad bacteriana y las alteraciones del micobioma¹¹.

Es importante destacar que el objetivo no es calificar los microorganismos simplemente como «buenos» o «malos», sino comprender las complejas interacciones de toda la red microbiana.

¿Qué papel desempeña la alimentación?

La dieta se considera uno de los factores que más influyen en el microbioma¹².

En particular, la fibra dietética sirve como principal fuente de energía para muchas bacterias intestinales. Durante la fermentación, las bacterias producen ácidos grasos de cadena corta, como:

• Butirato

• Acetato

• Propionato

Estos subproductos metabólicos se estudian intensamente en relación con la función de la barrera intestinal, la regulación inmunológica y la estabilidad microbiana¹³.

Al mismo tiempo, la investigación estudia cómo los distintos patrones alimentarios pueden influir en el equilibrio entre bacterias y hongos.

Las dietas muy procesadas, la baja ingesta de fibra y los patrones de estilo de vida occidental se mencionan con frecuencia en relación con las alteraciones del microbioma¹⁴.

Candida y la barrera intestinal

La barrera intestinal es uno de los sistemas de protección más importantes del cuerpo¹⁵.

Está formada por:

• Células intestinales

• Capas de moco

• Células inmunitarias

• Microorganismos del microbioma

Actualmente, la investigación estudia intensamente cómo los microorganismos bacterianos y fúngicos interactúan con esta barrera intestinal.

Resulta especialmente fascinante que:

El propio microbioma forma un tipo de capa biológica protectora a lo largo de la superficie intestinal.

Cuando este ecosistema sumamente complejo pierde su equilibrio, también pueden alterarse los procesos asociados a la inflamación¹⁶.

¿Cómo se analiza Candida?

Muchas pruebas tradicionales del microbioma se centran principalmente en las bacterias y se basan en los llamados métodos 16S.

Sin embargo, estos métodos detectan los hongos solo en una medida muy limitada, o no los detectan en absoluto¹⁷.

La secuenciación shotgun moderna va mucho más allá.

En lugar de centrarse únicamente en las regiones marcadoras bacterianas, analiza todo el ADN microbiano de una muestra. Esto permite investigar simultáneamente bacterias, hongos, virus y muchos otros microorganismos¹⁸.

En Bactera utilizamos la secuenciación shotgun moderna para obtener la imagen más completa posible del microbioma intestinal.

Con nuestro enfoque Microbiome 360°, analizamos:

Área	Qué se analiza
Diversidad bacteriana	Diversidad alfa y estabilidad microbiana
Hongos y levaduras	Incluidas diversas especies de Candida
Virus y fagos	Componentes del viroma
Potencial funcional	Patrones metabólicos microbianos
Genes de resistencia	Patrones genéticos asociados a la resistencia

Aspectos importantes a comprender

La detección de Candida no indica automáticamente una enfermedad²⁰.

Muchos hongos pueden formar parte de forma natural del microbioma humano. Por lo tanto, la interpretación de estos hallazgos debe realizarse siempre en el contexto microbiano más amplio.

Estos análisis están destinados a la interpretación científica y educativa de los patrones microbianos y no sustituyen al diagnóstico ni al tratamiento médico.

Conclusión

El microbioma intestinal no solo consta de bacterias, sino también de hongos, virus y muchos otros microorganismos.

Candida, en particular, se ha convertido en uno de los principales focos de la investigación moderna sobre el microbioma. Los científicos estudian intensamente cómo interactúan la diversidad bacteriana, los antibióticos, la alimentación y la barrera intestinal con el micobioma.

La secuenciación shotgun moderna permite ahora obtener información mucho más profunda sobre estas redes microbianas sumamente complejas que los métodos tradicionales.

Precisamente por ello, la investigación sobre los hongos y la salud intestinal es cada vez más importante en la ciencia moderna del microbioma.

Referencias científicas

1. Iliev ID, Leonardi I. Fungal dysbiosis insights into altered host microbiota interactions. Nature Reviews Immunology. 2021.

2. Nash AK, Auchtung TA, Wong MC et al. The gut mycobiome of the Human Microbiome Project healthy cohort. Microbiome. 2022.

3. Underhill DM, Iliev ID. The mycobiota interactions between commensal fungi and the host immune system. Nature Reviews Immunology. 2021.

4. Leonardi I, Gao IH, Lin WY et al. Mucosal fungi promote gut barrier function and resilience. Cell. 2022.

5. Arfken AM, Frey JF, Ramsay TG. Fungal microbiota of the gastrointestinal tract. Frontiers in Microbiology. 2021.

6. Richard ML, Sokol H. The gut mycobiota interactions with the bacterial microbiota and host immunity. Gut Microbes. 2021.

7. Dethlefsen L, Relman DA. Antibiotic perturbations of the human gut microbiota. Cell Host & Microbe. 2021.

8. Zhai B, Ola M, Rolling T et al. High resolution mycobiota analysis reveals dynamic intestinal translocation preceding invasive candidiasis. Nature Medicine. 2021.

9. Lozupone CA, Stombaugh JI, Gordon JI et al. Diversity stability and resilience of the human gut microbiota. Nature. 2022.

10. Gacesa R, Kurilshikov A, Vich Vila A et al. Environmental factors shaping the gut microbiome. Nature. 2022.

11. Wheeler ML, Limon JJ, Underhill DM. Immunity to commensal fungi in the intestine. Current Opinion in Immunology. 2021.

12. Asnicar F, Berry SE, Valdes AM et al. Microbiome connections with host metabolism and habitual diet. Nature Medicine. 2021.

13. Makki K, Deehan EC, Walter J et al. The impact of dietary fiber on gut microbiota in host health and disease. Cell Host & Microbe. 2023.

14. Sonnenburg ED, Sonnenburg JL. The ancestral and industrialized gut microbiota. Nature Reviews Microbiology. 2021.

15. Turner JR. Intestinal mucosal barrier function in health and disease. Nature Reviews Immunology. 2021.

16. Fan Y, Pedersen O. Gut microbiota in human metabolic health and disease. Nature Reviews Microbiology. 2021.

17. Quince C, Walker AW, Simpson JT et al. Shotgun metagenomics from sampling to analysis. Nature Biotechnology. 2021.

18. Knight R, Vrbanac A, Taylor BC et al. Best practices for analysing microbiomes. Nature Reviews Microbiology. 2022.

19. Almeida A, Nayfach S, Boland M et al. A unified catalog of reference genomes from the human gut microbiome. Nature Biotechnology. 2021.

20. Sokol H, Leducq V, Aschard H et al. Fungal microbiota dysbiosis in inflammatory bowel disease. Gut. 2021.