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¿Qué es el viroma intestinal? Explicación de los virus, los fagos y el microbioma humano
El viroma intestinal es la comunidad de virus que vive en tu sistema digestivo, incluidos los bacteriófagos que dan forma al microbioma intestinal. Descubre qué es el viroma intestinal y por qué es importante para la salud humana.
Viroma y microbioma intestinal
Cuando la gente habla del microbioma intestinal, la mayoría piensa primero en las bacterias. Sin embargo, en realidad, el microbioma humano consiste en mucho más que solo microorganismos bacterianos¹.
El ecosistema intestinal también incluye:
- Bacterias
- Hongos
- Virus
- Bacteriófagos
- Arqueas
La colección de virus dentro del microbioma se denomina viroma².
En los últimos años, la investigación ha comenzado a comprender que los virus también pueden desempeñar un papel importante dentro de los ecosistemas microbianos.
¿Qué es el viroma?
El viroma incluye todos los componentes virales dentro de una comunidad microbiana³.
Esto incluye:
- Virus que infectan las células humanas
- Bacteriófagos que infectan bacterias
- Fragmentos genéticos virales dentro del microbioma
Particularmente interesante:
El viroma intestinal es extremadamente complejo y altamente individual. Muchas secuencias virales dentro del intestino humano permanecen científicamente sin caracterizar hasta el día de hoy⁴.
El microbioma intestinal consiste en más que solo bacterias
La investigación moderna del microbioma muestra cada vez más que las comunidades bacterianas interactúan estrechamente con los componentes virales⁵.
Los bacteriófagos en particular pueden desempeñar un papel importante en:
- Estabilidad microbiana
- Diversidad bacteriana
- Dinámica de resistencia
- Interacciones microbianas
Como resultado, el viroma se está convirtiendo en un área cada vez más importante de la investigación moderna del microbioma.
Virus de ADN y virus de ARN
Los virus difieren fundamentalmente en su estructura genética.
Algunos virus contienen:
- ADN como material genético
- ARN como material genético
Esta distinción es especialmente importante para las tecnologías modernas de secuenciación.
En Bactera, utilizamos secuenciación de ADN shotgun. Por lo tanto, analizamos principalmente los componentes basados en ADN del microbioma⁶.
Importante entender:
Muchos virus intestinales bien conocidos son virus de ARN. Estos solo se detectan parcialmente, o no se detectan en absoluto, a través de la pura secuenciación de ADN.
Esto significa:
Una prueba de microbioma basada en ADN no representa el viroma humano completo.
¿Qué componentes virales se pueden analizar?
Usando la moderna secuenciación de ADN shotgun, se pueden analizar varios componentes virales basados en ADN⁷.
Estos incluyen, por ejemplo:
- Ciertos adenovirus
- Secuencias asociadas a bacteriófagos
- Virus de ADN dentro de comunidades microbianas
Los adenovirus están entre los virus de ADN mejor conocidos en humanos.
Algunos tipos de adenovirus pueden estar asociados con síntomas gastrointestinales⁸.
Importante:
La detección de ADN viral no indica automáticamente una infección activa o enfermedad.
Los resultados están destinados a la interpretación científica y educativa de los patrones microbianos.
¿Por qué el viroma es científicamente interesante?
El viroma es actualmente uno de los campos de investigación de más rápido crecimiento dentro de la ciencia del microbioma⁹.
Los científicos están investigando intensamente:
- Cómo los virus influyen en las comunidades bacterianas
- Cómo los fagos interactúan con el resistoma
- Cómo el viroma difiere entre individuos
- Cómo la dieta y los factores ambientales pueden influir en el viroma
Particularmente fascinante:
Muchas secuencias virales dentro del intestino humano permanecen científicamente desconocidas hasta el día de hoy¹⁰.
Nuestro enfoque en Bactera
En Bactera, utilizamos metagenómica shotgun moderna y bioinformática científica.
Con nuestro enfoque Microbiome 360°, analizamos:
| Área | Qué se analiza |
|---|---|
| Diversidad bacteriana | Diversidad alfa y estabilidad microbiana |
| Genes de resistencia | Patrones genéticos asociados a la resistencia |
| Hongos y levaduras | Varios componentes del micobioma |
| Viroma | Secuencias virales basadas en ADN |
| Fagos | Componentes asociados a bacteriófagos |
Importante entender:
Debido a que utilizamos secuenciación de ADN, muchos virus de ARN del intestino no se detectan por completo.
El análisis está destinado a la interpretación científica y educativa de los patrones microbianos y no reemplaza el diagnóstico viral médico.
Conclusión
El microbioma intestinal humano consiste no solo de bacterias, sino también de una diversidad altamente compleja de componentes virales.
El viroma se está convirtiendo ahora en uno de los campos más emocionantes de la investigación moderna del microbioma.
Usando la moderna secuenciación de ADN shotgun, ciertos componentes virales basados en ADN, incluyendo adenovirus y secuencias asociadas a bacteriófagos, pueden ser analizados.
Al mismo tiempo, es importante entender que muchos virus intestinales son virus basados en ARN y por lo tanto solo se detectan parcialmente a través de la secuenciación de ADN por sí sola.
Esta es exactamente la razón por la cual la investigación del viroma está evolucionando tan dinámicamente y continuamente proporcionando nuevas perspectivas sobre el microbioma humano.
Referencias científicas
- Almeida A, Nayfach S, Boland M et al. A unified catalog of reference genomes from the human gut microbiome. Nature Biotechnology. 2021.
- Shkoporov AN, Hill C. Bacteriophages of the human gut. Cell Host & Microbe. 2021.
- Gregory AC, Zablocki O, Howell A et al. The human gut virome database. Cell Host & Microbe. 2022.
- Camarillo Guerrero LF, Almeida A, Rangel P et al. Massive expansion of human gut bacteriophage diversity. Cell. 2021.
- Sutton TDS, Hill C. Gut bacteriophage communities in human health and disease. Viruses. 2021.
- Quince C, Walker AW, Simpson JT et al. Shotgun metagenomics from sampling to analysis. Nature Biotechnology. 2021.
- Aggarwala V, Liang G, Bushman FD. Viral communities of the human gut. Annual Review of Virology. 2021.
- Lynch JP, Kajon AE. Adenovirus epidemiology pathogenesis and clinical disease. Journal of Clinical Microbiology. 2021.
- Liang G, Bushman FD. The human virome in health and disease. Nature Reviews Microbiology. 2021.
- Gregory AC, Zayed AA, Conceição Neto N et al. Marine DNA viral macro and microdiversity from pole to pole. Cell. 2021.
- Knight R, Vrbanac A, Taylor BC et al. Best practices for analysing microbiomes. Nature Reviews Microbiology. 2022.
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