Candida i mikrobiom jelitowy

Ludzki mikrobiom jelitowy składa się z miliardów drobnoustrojów, które razem tworzą niezwykle złożony ekosystem mikrobiologiczny. Oprócz bakterii obejmuje on również grzyby, wirusy i wiele innych drobnoustrojów. Jednym z grzybów, o którym mówi się szczególnie często, jest Candida¹.

Wiele osób kojarzy Candidę przede wszystkim z takimi terminami jak „nadmiar Candida” lub stosowaniem antybiotyków. Jednak rzeczywistość naukowa jest znacznie bardziej złożona, niż często przedstawia się ją w mediach.

Niektóre gatunki Candida mogą naturalnie występować w mikrobiomie jelitowym nawet u zdrowych osób². Dlatego kluczowym czynnikiem nie jest samo obecne Candida, lecz to, jak zrównoważony jest cały ekosystem mikrobiologiczny w jelitach.

Współczesne badania nad mikrobiomem intensywnie analizują obecnie, jak grzyby oddziałują na bakterie, dietę, antybiotyki i barierę jelitową.

Czym jest Candida?

Candida to grupa grzybów drożdżowych, które mogą naturalnie występować na skórze, powierzchniach śluzówkowych i w jelitach³.

Najbardziej znanym gatunkiem jest:

• Candida albicans

Ten gatunek grzyba jest jednym z najintensywniej badanych drożdży w ludzkim organizmie.

Ważne:

Wykrycie Candida nie oznacza automatycznie choroby. Wiele drobnoustrojów, w tym drożdże, może być częścią prawidłowego ekosystemu mikrobiologicznego⁴.

Najważniejsza jest równowaga między różnymi grupami drobnoustrojów.

Mikrobiom jelitowy składa się nie tylko z bakterii

Wiele dyskusji na temat zdrowia jelit skupia się niemal wyłącznie na bakteriach. W rzeczywistości jednak mikrobiom jelitowy jest znacznie bardziej złożony.

Obejmuje on również:

• Bakterie

• Grzyby

• Wirusy

• Bakteriofagi

• Archeony

Zbiór grzybów w mikrobiomie nazywany jest mykobiomem⁵.

Chociaż grzybów jest znacznie mniej niż bakterii, nadal mogą one odgrywać ważne role w ekosystemie jelitowym.

Szczególnie fascynujące:

Grzyby i bakterie nieustannie oddziałują na siebie w jelitach. Niektóre drobnoustroje rywalizują ze sobą, podczas gdy inne wzajemnie się wspierają lub wspólnie wpływają na procesy metaboliczne⁶.

Jaką rolę odgrywają antybiotyki?

Antybiotyki należą do najważniejszych czynników wpływających na równowagę bakteryjną w jelitach⁷.

Ponieważ antybiotyki działają na bakterie, a nie na grzyby, ich stosowanie może zaburzyć równowagę między bakteriami a grzybami.

Badania wykazują, że po kontakcie z antybiotykami niektóre gatunki Candida mogą stać się łatwiejsze do wykrycia⁸.

Nie oznacza to jednak automatycznie choroby. Zamiast tego podkreśla, jak wrażliwy na czynniki zewnętrzne może być mikrobiologiczny ekosystem jelitowy.

Do szczególnie istotnych czynników należą:

• Powtarzające się kuracje antybiotykowe

• Długotrwałe stosowanie antybiotyków

• Zmniejszona różnorodność bakterii

• Osłabiona odporność mikrobiomu

Candida a różnorodność bakterii

Współczesne badania nad mikrobiomem intensywnie analizują związek między różnorodnością bakterii a stabilnością mikrobiomu⁹.

Różnorodny mikrobiom jest często uważany za bardziej odporny na czynniki stresogenne zewnętrzne.

Gdy różnorodność bakterii spada, na przykład po zastosowaniu antybiotyków lub z powodu bardzo niezbilansowanej diety, równowaga mikrobiologiczna może ulec zaburzeniu¹⁰.

Szczególnie interesujące:

Niektóre badania sugerują związek między zmniejszoną różnorodnością bakterii a zmianami w mykobiomie¹¹.

Ważne jest, aby nie etykietować drobnoustrojów jako po prostu „dobre” lub „złe”, lecz zrozumieć złożone interakcje w całej sieci mikrobiologicznej.

Jaką rolę odgrywa odżywianie?

Dieta jest uważana za jeden z najważniejszych czynników wpływających na mikrobiom¹².

Błonnik pokarmowy stanowi w szczególności główne źródło energii dla wielu bakterii jelitowych. Podczas fermentacji bakterie produkują krótkołańcowe kwasy tłuszczowe, takie jak:

• Maślan

• Acetat

• Propionian

Te produkty uboczne metabolizmu są intensywnie badane pod kątem funkcji bariery jelitowej, regulacji odporności i stabilności mikrobiologicznej¹³.

Jednocześnie badacze sprawdzają, jak różne wzorce żywieniowe mogą wpływać na równowagę między bakteriami a grzybami.

Diety wysoko przetworzone, niskie spożycie błonnika i zachodnie wzorce stylu życia są często omawiane w kontekście zmian w mikrobiomie¹⁴.

Candida a bariera jelitowa

Bariera jelitowa jest jednym z najważniejszych systemów ochronnych organizmu¹⁵.

Składa się ona z:

• Komórek jelitowych

• Warstw śluzowych

• Komórek odpornościowych

• Drobnoustrojów w mikrobiomie

Obecnie intensywnie bada się, jak bakterie i grzyby oddziałują z tą barierą jelitową.

Szczególnie fascynujące:

Sam mikrobiom tworzy rodzaj biologicznej warstwy ochronnej wzdłuż powierzchni jelit.

Gdy ten niezwykle złożony ekosystem traci równowagę, mogą również zmienić się procesy związane ze stanem zapalnym¹⁶.

Jak analizuje się Candidę?

Wiele tradycyjnych testów mikrobiomu skupia się głównie na bakteriach i opiera się na tzw. metodach 16S.

Metody te wykrywają jednak grzyby tylko w bardzo ograniczonym zakresie, a czasem wcale¹⁷.

Nowoczesne sekwencjonowanie shotgun pozwala na znacznie szersze analizy.

Zamiast skupiać się wyłącznie na regionach markerowych bakterii, analizuje ono całe DNA mikrobiologiczne w próbce. Pozwala to na jednoczesne zbadanie bakterii, grzybów, wirusów i wielu innych drobnoustrojów¹⁸.

W Bactera wykorzystujemy nowoczesne sekwencjonowanie shotgun, aby uzyskać jak najpełniejszy obraz mikrobiomu jelitowego.

Dzięki naszemu podejściu Microbiome 360° analizujemy:

Obszar	Co jest analizowane
Różnorodność bakterii	Różnorodność alfa i stabilność mikrobiologiczna
Grzyby i drożdże	W tym różne gatunki Candida
Wirusy i fagi	Składniki wiromu
Potencjały funkcjonalne	Wzorce metaboliczne drobnoustrojów
Geny oporności	Wzorce genetyczne związane z opornością

Ważne do zrozumienia

Wykrycie Candida nie oznacza automatycznie choroby²⁰.

Wiele grzybów może naturalnie występować w ludzkim mikrobiomie. Dlatego interpretacja takich wyników musi zawsze uwzględniać szerszy kontekst mikrobiologiczny.

Analizy te służą do naukowego i edukacyjnego interpretowania wzorców mikrobiologicznych i nie zastępują diagnozy ani leczenia medycznego.

Podsumowanie

Mikrobiom jelitowy składa się nie tylko z bakterii, ale także z grzybów, wirusów i wielu innych drobnoustrojów.

Candida stała się w szczególności głównym punktem zainteresowania współczesnych badań nad mikrobiomem. Naukowcy intensywnie badają, jak różnorodność bakterii, antybiotyki, odżywianie i bariera jelitowa oddziałują na mykobiom.

Nowoczesne sekwencjonowanie shotgun pozwala obecnie na znacznie głębsze poznanie tych niezwykle złożonych sieci mikrobiologicznych niż metody tradycyjne.

Właśnie dlatego badania dotyczące grzybów i zdrowia jelit stają się coraz ważniejszą częścią współczesnej nauki o mikrobiomie.

Źródła naukowe

1. Iliev ID, Leonardi I. Wnioski z dysbiozy grzybowej dotyczące zaburzeń interakcji mikroflory gospodarza. Nature Reviews Immunology. 2021.

2. Nash AK, Auchtung TA, Wong MC i inni. Mykobiom jelitowy zdrowej kohorty z Human Microbiome Project. Microbiome. 2022.

3. Underhill DM, Iliev ID. Interakcje mykobiomu między grzybami komensalnymi a układem odpornościowym gospodarza. Nature Reviews Immunology. 2021.

4. Leonardi I, Gao IH, Lin WY i inni. Grzyby śluzówkowe wspierają funkcję bariery jelitowej i odporność. Cell. 2022.

5. Arfken AM, Frey JF, Ramsay TG. Mikrobiota grzybowa przewodu pokarmowego. Frontiers in Microbiology. 2021.

6. Richard ML, Sokol H. Interakcje mykobiomu jelitowego z bakteriami i odpornością gospodarza. Gut Microbes. 2021.

7. Dethlefsen L, Relman DA. Wpływ antybiotyków na ludzką mikrobiotę jelitową. Cell Host & Microbe. 2021.

8. Zhai B, Ola M, Rolling T i inni. Analiza mykobiomu o wysokiej rozdzielczości ujawnia dynamiczną translokację jelitową poprzedzającą inwazyjną kandydozę. Nature Medicine. 2021.

9. Lozupone CA, Stombaugh JI, Gordon JI i inni. Stabilność i odporność ludzkiej mikrobioty jelitowej. Nature. 2022.

10. Gacesa R, Kurilshikov A, Vich Vila A i inni. Czynniki środowiskowe kształtujące mikrobiom jelitowy. Nature. 2022.

11. Wheeler ML, Limon JJ, Underhill DM. Odporność na grzyby komensalne w jelitach. Current Opinion in Immunology. 2021.

12. Asnicar F, Berry SE, Valdes AM i inni. Związki mikrobiomu z metabolizmem gospodarza i nawykami żywieniowymi. Nature Medicine. 2021.

13. Makki K, Deehan EC, Walter J i inni. Wpływ błonnika pokarmowego na mikrobiotę jelitową w zdrowiu i chorobie gospodarza. Cell Host & Microbe. 2023.

14. Sonnenburg ED, Sonnenburg JL. Przodkowa i uprzemysłowiona mikrobiota jelitowa. Nature Reviews Microbiology. 2021.

15. Turner JR. Funkcja bariery śluzowej jelit w zdrowiu i chorobie. Nature Reviews Immunology. 2021.

16. Fan Y, Pedersen O. Mikrobiota jelitowa w zdrowiu metabolicznym i chorobach człowieka. Nature Reviews Microbiology. 2021.

17. Quince C, Walker AW, Simpson JT i inni. Metagenomika shotgun od pobrania do analizy. Nature Biotechnology. 2021.

18. Knight R, Vrbanac A, Taylor BC i inni. Najlepsze praktyki analizy mikrobiomów. Nature Reviews Microbiology. 2022.

19. Almeida A, Nayfach S, Boland M i inni. Ujednolicony katalog genomów referencyjnych z ludzkiego mikrobiomu jelitowego. Nature Biotechnology. 2021.

20. Sokol H, Leducq V, Aschard H i inni. Dysbioza grzybowa w chorobie wrzodziejącej jelita grubego. Gut. 2021.